Située dans le comté de Charlevoix, la rivière du Gouffre prend sa  source au lac des Coeurs dans le parc des Grands Jardins, à 822,96 mètres d'altitude. Elle coule sur 71 kms, du nord au sud, avec un parcours des plus sinueux pour enfin se déverser dans le fleuve Saint-Laurent à Baie Saint-Paul.

Elle draine 1010 kms carrés de territoire où l'on dénombre 185 lacs et 35 affluents dont les principaux sont les rivières du Gouffre Nord-Ouest, de la Mare, du Gouffre Sud-Ouest et des îlots.                    

On y retrouve deux vallées, la vallée du Gouffre qui s'étend de Saint-Urbain jusqu'à l'embouchure. La deuxième se trouve dans la région de Notre-Dame-des-Monts.

En passant, la rivière du Gouffre fit l'objet d'une pêche aux huitres perlées (moules d'eau douce) aux alentours de 1909.